Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
P3H1Q32P28 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P3H1Q32P28 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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