Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEACAM16Q2WEN9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEACAM16Q2WEN9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms