Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM71Q2Q1W2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms