Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNGA3Q16281 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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CNGA3Q16281 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNGA3Q16281 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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