Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC6Q16204 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC6Q16204 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms