Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA6Q15825 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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