Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGN3Q15651 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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