Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF13Q15543 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF13Q15543 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms