Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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SIX1Q15475 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIX1Q15475 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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