Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.466e-22■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-8■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-8■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 TEX261-205ENST00000478068 3579 ntTSL 29.38□□□□□ -0.913e-8■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 AC007040.2-202ENST00000453130 423 ntTSL 38.37□□□□□ -1.073e-8■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 210.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.171e-7■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.171e-7■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.081e-7■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.611e-7■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.491e-7■■■■□ 20.3
PCBP1Q15365 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 BCOR-211ENST00000490976 3480 ntTSL 28.49□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SYVN1-209ENST00000527765 516 ntTSL 314.4□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.181e-8■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.389e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.399e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 LSM2-210ENST00000470086 713 ntTSL 28.97□□□□□ -0.971e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 RNF44-202ENST00000504160 887 ntTSL 318.97■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-203ENST00000597353 538 ntTSL 523.91■■□□□ 1.425e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 523.38■■□□□ 1.335e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-206ENST00000599362 555 ntTSL 220.73■□□□□ 0.915e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-205ENST00000598923 952 ntTSL 220.52■□□□□ 0.885e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-207ENST00000599570 925 ntTSL 315.32■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-208ENST00000600456 592 ntTSL 315.32■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 SNRPA-209ENST00000601253 519 ntTSL 315.32■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.961e-10■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 212.99□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 20.2
PCBP1Q15365 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.662e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PRSS21-207ENST00000574813 873 ntTSL 320.89■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.128e-7■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.664e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.64e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MAPK3-207ENST00000466521 1878 ntTSL 531.31■■■□□ 2.64e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MAPK3-214ENST00000490298 1718 ntTSL 529.76■■■□□ 2.354e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-210ENST00000512760 1431 ntTSL 1 (best)26.51■■□□□ 1.834e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PFKL-203ENST00000460020 890 ntTSL 525.17■■□□□ 1.624e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-201ENST00000342820 2153 ntTSL 1 (best)24.4■■□□□ 1.54e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 324.01■■□□□ 1.434e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-205ENST00000573842 495 ntTSL 223.72■■□□□ 1.394e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.344e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.344e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-209ENST00000576921 1199 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.344e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-208ENST00000575214 1365 ntTSL 222.93■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HSPG2-205ENST00000427897 589 ntTSL 522.93■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SND1-214ENST00000489417 1447 ntTSL 222.74■■□□□ 1.234e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.184e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RAC3-202ENST00000580965 831 ntTSL 222.27■■□□□ 1.164e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.074e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.054e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-204ENST00000573095 828 ntTSL 321.57■■□□□ 1.044e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.014e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.924e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-205ENST00000518340 582 ntTSL 320.6■□□□□ 0.894e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 520.46■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.841e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.834e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 CORO1B-204ENST00000537042 1954 ntTSL 520.1■□□□□ 0.811e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.714e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-206ENST00000520303 1803 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MAPK3-213ENST00000485579 739 ntTSL 219.15■□□□□ 0.664e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TCF25-211ENST00000563636 721 ntTSL 219.14■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 DNM1-218ENST00000635859 100 ntTSL 518.95■□□□□ 0.621e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RIPOR3-206ENST00000488529 953 ntTSL 518.73■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 CORO1B-205ENST00000539724 615 ntTSL 318.71■□□□□ 0.591e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RAC3-203ENST00000584341 730 ntTSL 516.66■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-202ENST00000395594 3995 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 BICRA-203ENST00000602258 3312 nt15.42■□□□□ 0.064e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 TCF25-221ENST00000568409 857 ntTSL 315.27■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SARAF-208ENST00000521265 1741 ntTSL 514.86□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 HSPG2-213ENST00000498495 488 ntTSL 214.2□□□□□ -0.144e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.24e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 CORO1B-209ENST00000616321 4464 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-8■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.274e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 KXD1-214ENST00000600654 895 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-6■■■■□ 20.1
PCBP1Q15365 PAQR3-206ENST00000508599 549 ntTSL 412.66□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 20.1
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