Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PSME4Q14997 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSME4Q14997 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms