Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDCD11Q14690 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD11Q14690 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms