Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB33AQ14088 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB33AQ14088 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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