Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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DNASE1L3Q13609 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DNASE1L3Q13609 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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