Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NAE1Q13564 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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NAE1Q13564 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NAE1Q13564 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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