Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms