Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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