Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MTA1Q13330 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA1Q13330 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MTA1Q13330 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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MTA1Q13330 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA1Q13330 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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