Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SELENBP1Q13228 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SELENBP1Q13228 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SELENBP1Q13228 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SELENBP1Q13228 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SELENBP1Q13228 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SELENBP1Q13228 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SELENBP1Q13228 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SELENBP1Q13228 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SELENBP1Q13228 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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