Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR1H3Q13133 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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