Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRDM2Q13029 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
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