Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
BNIP1Q12981 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms