Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIAQ12857 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIAQ12857 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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