Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STX4Q12846 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
STX4Q12846 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
STX4Q12846 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
STX4Q12846 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
STX4Q12846 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms