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Protein–RNA interactions for Protein: Q12502
LDB19, Protein LDB19, yeast
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818 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
LDB19
Q12502
SYP1
YCR030C
2613 nt
5.03
□□□□□ -1.6
LDB19
Q12502
YIR044C
YIR044C
186 nt
5.02
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YML057C-A
YML057C-A
390 nt
5.02
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
ISU1
YPL135W
498 nt
5.02
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YPL278C
YPL278C
303 nt
5.02
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YBR221W-A
YBR221W-A
105 nt
5.02
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
RIM15
YFL033C
5313 nt
5.01
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
ASK10
YGR097W
3441 nt
5.01
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
FRE2
YKL220C
2136 nt
5.01
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
SEC9
YGR009C
1956 nt
5.01
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
GLT1
YDL171C
6438 nt
5.01
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
NOP4
YPL043W
2058 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
RRM3
YHR031C
2172 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YDR286C
YDR286C
345 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
RAM2
YKL019W
951 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YAR019W-A
YAR019W-A
333 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
TRM44
YPL030W
1704 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
CYK3
YDL117W
2658 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
TPS2
YDR074W
2691 nt
5
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
SYG1
YIL047C
2709 nt
4.99
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
TFB1
YDR311W
1929 nt
4.99
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
TUP1
YCR084C
2142 nt
4.99
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YDR239C
YDR239C
2364 nt
4.98
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
PBS2
YJL128C
2007 nt
4.98
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YCR087C-A
YCR087C-A
462 nt
4.98
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
SSS1
YDR086C
243 nt
4.98
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
BAS1
YKR099W
2436 nt
4.98
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
CAF4
YKR036C
1932 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
APC5
YOR249C
2058 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
RBK1
YCR036W
1002 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
ERP6
YGL002W
651 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
RPL38
YLR325C
237 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YNL266W
YNL266W
420 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
YIL166C
YIL166C
1629 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
MES1
YGR264C
2256 nt
4.97
□□□□□ -1.61
LDB19
Q12502
SLD3
YGL113W
2007 nt
4.96
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
MCM4
YPR019W
2802 nt
4.96
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
STF2
YGR008C
255 nt
4.96
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
CLF1
YLR117C
2064 nt
4.96
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
PDC2
YDR081C
2778 nt
4.96
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
LYP1
YNL268W
1836 nt
4.95
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SED4
YCR067C
3198 nt
4.95
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
PDR10
YOR328W
4695 nt
4.95
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
YPR053C
YPR053C
456 nt
4.95
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
OPT2
YPR194C
2634 nt
4.95
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
PUF6
YDR496C
1971 nt
4.95
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
COY1
YKL179C
2040 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
ATH1
YPR026W
3636 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
YER091C-A
YER091C-A
222 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
COX23
YHR116W
456 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
RPS18B
YML026C
441 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
NTC20
YBR188C
423 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
YBR206W
YBR206W
324 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
VAC14
YLR386W
2643 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SUM1
YDR310C
3189 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SIR3
YLR442C
2937 nt
4.94
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
HPC2
YBR215W
1878 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
PSE1
YMR308C
3270 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
BUD6
YLR319C
2367 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
GYP7
YDL234C
2241 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SAP155
YFR040W
3009 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
MSS11
YMR164C
2277 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
ZIP1
YDR285W
2628 nt
4.93
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
ABF1
YKL112W
2196 nt
4.92
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
TDA1
YMR291W
1761 nt
4.92
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
CMC4
YMR194C-B
222 nt
4.92
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
snR10
snR10
245 nt
4.92
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
GMC1
YDR506C
1827 nt
4.92
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SBE2
YDR351W
2595 nt
4.92
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SUP56
tL(CAA)A
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SUP53
tL(CAA)C
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)D
tL(CAA)D
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)G1
tL(CAA)G1
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
SUP54
tL(CAA)G2
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)G3
tL(CAA)G3
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)K
tL(CAA)K
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)L
tL(CAA)L
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)M
tL(CAA)M
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
tL(CAA)N
tL(CAA)N
82 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
YOR345C
YOR345C
351 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
MET12
YPL023C
1974 nt
4.91
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
COP1
YDL145C
3606 nt
4.9
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
ARK1
YNL020C
1917 nt
4.9
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
TIF4631
YGR162W
2859 nt
4.9
□□□□□ -1.62
LDB19
Q12502
RPL28
YGL103W
450 nt
4.9
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
YLR154W-B
YLR154W-B
165 nt
4.9
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
MBP1
YDL056W
2502 nt
4.9
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
FAA3
YIL009W
2085 nt
4.9
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
PTA1
YAL043C
2358 nt
4.9
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
KRS1
YDR037W
1776 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
ROT2
YBR229C
2865 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
YER187W
YER187W
426 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
COX5B
YIL111W
456 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
RPL14A
YKL006W
417 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
KIN4
YOR233W
2403 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
STE20
YHL007C
2820 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
APC4
YDR118W
1959 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
UBP10
YNL186W
2379 nt
4.89
□□□□□ -1.63
LDB19
Q12502
ZIP2
YGL249W
2115 nt
4.88
□□□□□ -1.63
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