Protein–RNA interactions for Protein: Q12368

SNU23, 23 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU23Q12368 ATG38YLR211C 681 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU23Q12368 PRE8YML092C 753 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU23Q12368 TOA1YOR194C 861 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU23Q12368 DGK1YOR311C 873 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU23Q12368 LHS1YKL073W 2646 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU23Q12368 NIC96YFR002W 2520 nt1.72□□□□□ -2.13
SNU23Q12368 CDC53YDL132W 2448 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RTP1YMR185W 2946 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 STD1YOR047C 1335 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 UBR2YLR024C 5619 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YCR013CYCR013C 648 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SNC1YAL030W 354 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 EMC6YLL014W 327 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 TMA7YLR262C-A 195 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YOL150CYOL150C 312 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SPR2YOR214C 711 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.71□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 UBC5YDR059C 447 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 PRS3YHL011C 963 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YJL086CYJL086C 369 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SRP21YKL122C 504 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RLP24YLR009W 600 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YLR053CYLR053C 327 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SMD3YLR147C 306 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 VPS63YLR261C 327 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RIO2YNL207W 1278 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 ADF1YCL058W-A 342 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 MNE1YOR350C 1992 nt1.7□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SAP190YKR028W 3102 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 HOP2YGL033W 657 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 COX3Q0275 810 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 TRS20YBR254C 528 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 TUS1YLR425W 3924 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 PTC5YOR090C 1719 nt1.69□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 CHC1YGL206C 4962 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YDL157CYDL157C 357 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YDR018CYDR018C 1191 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 LOC1YFR001W 615 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 MSL1YIR009W 336 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 HYR1YIR037W 492 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YJL147CYJL147C 1149 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RAM2YKL019W 951 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 CSE4YKL049C 690 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YAL064WYAL064W 285 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YML084WYML084W 309 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 LSM7YNL147W 348 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YNL179CYNL179C 438 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SET2YJL168C 2202 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SAG1YJR004C 1953 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 PKH3YDR466W 2697 nt1.68□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 CAT2YML042W 2013 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 MYO2YOR326W 4725 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RPL37BYDR500C 267 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YFR057WYFR057W 456 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RSM27YGR215W 333 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 NOP10YHR072W-A 177 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 RPL40AYIL148W 387 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YJR023CYJR023C 402 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 SPC2YML055W 537 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 URA5YML106W 681 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 NCS2YNL119W 1482 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YJL070CYJL070C 2667 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 UTP22YGR090W 3714 nt1.67□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 AHC2YCR082W 387 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 AAD16YFL057C 459 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 CWC23YGL128C 852 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 YLR458WYLR458W 381 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 PEP1YBL017C 4740 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 VPS38YLR360W 1320 nt1.66□□□□□ -2.14
SNU23Q12368 snR70snR70 164 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 TSA2YDR453C 591 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 IRC20YLR247C 4671 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YPL034WYPL034W 498 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 DNA2YHR164C 4569 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 KAR9YPL269W 1935 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 SPO22YIL073C 2928 nt1.65□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 LEU3YLR451W 2661 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 UBP1YDL122W 2430 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 CDC50YCR094W 1176 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YDR248CYDR248C 582 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YDR286CYDR286C 345 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YGL042CYGL042C 306 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YGL218WYGL218W 651 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 END3YNL084C 1050 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 BRX1YOL077C 876 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 SFG1YOR315W 1041 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 PDR3YBL005W 2931 nt1.64□□□□□ -2.15
SNU23Q12368 NCL1YBL024W 2055 nt1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms