Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 GPI17YDR434W 1605 nt3.07□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 GIN4YDR507C 3429 nt3.07□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 RPO41YFL036W 4056 nt3.07□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 DYN1YKR054C 12279 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 MIX14YDR031W 366 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 VTC1YER072W 390 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 AAD16YFL057C 459 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 MPO1YGL010W 525 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 RAD6YGL058W 519 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 PSO2YMR137C 1986 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 YNL034WYNL034W 1839 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 RPB11YOL005C 363 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 BUD4YJR092W 4344 nt3.06□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 SMC6YLR383W 3345 nt3.05□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 YGR290WYGR290W 444 nt3.05□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt3.05□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 SPO71YDR104C 3738 nt3.05□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 YGR067CYGR067C 2415 nt3.05□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 UBP14YBR058C 2346 nt3.05□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 SNU56YDR240C 1479 nt3.04□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 VPS20YMR077C 666 nt3.04□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 YBL065WYBL065W 345 nt3.04□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 TUS1YLR425W 3924 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 BAS1YKR099W 2436 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 APL5YPL195W 2799 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 YIL080WYIL080W 4722 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 AHC2YCR082W 387 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 RTR2YDR066C 591 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 GAL7YBR018C 1101 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 PUT3YKL015W 2940 nt3.03□□□□□ -1.92
NYV1Q12255 MDM32YOR147W 1869 nt3.03□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 DPB11YJL090C 2295 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RPL14BYHL001W 417 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RPL16AYIL133C 600 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 TPM2YIL138C 486 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RPS22AYJL190C 393 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YJR023CYJR023C 402 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 MRPL44YMR225C 297 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 SWM2YNR004W 441 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RGL1YPL066W 1440 nt3.02□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 MXR1YER042W 555 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RTS3YGR161C 792 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RNR4YGR180C 1038 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YAP3YHL009C 993 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YIL058WYIL058W 285 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YIL174WYIL174W 228 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 DLS1YJL065C 504 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YJL202CYJL202C 348 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RSA1YPL193W 1146 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 BPT1YLL015W 4680 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 NUP170YBL079W 4509 nt3.01□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 PSK2YOL045W 3306 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YKR051WYKR051W 1257 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YLR230WYLR230W 306 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RPL36AYMR194W 303 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 ECM5YMR176W 4236 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 NDD1YOR372C 1665 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 ARP8YOR141C 2646 nt3□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 TRS130YMR218C 3309 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 HRD3YLR207W 2502 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 SSE1YPL106C 2082 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 INP52YNL106C 3552 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 DBP7YKR024C 2229 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 GPI8YDR331W 1236 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YHR130CYHR130C 336 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 PEP8YJL053W 1140 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 VPH2YKL119C 648 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 TRM7YBR061C 933 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YBR197CYBR197C 654 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 NUP120YKL057C 3114 nt2.99□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 UTP13YLR222C 2454 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 ESL2YKR096W 3588 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 PRP6YBR055C 2700 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 PET123YOR158W 957 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YER138CYER138C 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YER160CYER160C 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YJR027WYJR027W 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YML039WYML039W 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YML045WYML045W 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YMR050CYMR050C 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 TMN3YER113C 2121 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 RTT10YPL183C 3042 nt2.98□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 JSN1YJR091C 3276 nt2.97□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 LEU3YLR451W 2661 nt2.97□□□□□ -1.93
NYV1Q12255 PHO91YNR013C 2685 nt2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.5 ms