Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 GDI1YER136W 1356 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 ARK1YNL020C 1917 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 NEW1YPL226W 3591 nt2.69□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 FAR11YNL127W 2862 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 BAT1YHR208W 1182 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YIL012WYIL012W 342 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YKL044WYKL044W 321 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YKL202WYKL202W 582 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 SDO1YLR022C 753 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 ATX2YOR079C 942 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RPS12YOR369C 432 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YPL205CYPL205C 345 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YPR014CYPR014C 330 nt2.68□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 UBP2YOR124C 3819 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YEL1YBL060W 2064 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 SEC16YPL085W 6588 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 DFG10YIL049W 762 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 AFB1YLR040C 675 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RIO2YNL207W 1278 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 BOI1YBL085W 2943 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 TFC3YAL001C 3483 nt2.67□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 ASM4YDL088C 1587 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 SSF1YHR066W 1362 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RGR1YLR071C 3249 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RPL27BYDR471W 411 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 COX13YGL191W 390 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RPL16AYIL133C 600 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 GPI14YJR013W 1212 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 RRT1YBL048W 312 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 SVS1YPL163C 783 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 DAD3YBR233W-A 285 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 PDR3YBL005W 2931 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 UBP16YPL072W 1500 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 SAP185YJL098W 3177 nt2.66□□□□□ -1.98
LSP1Q12230 YPK1YKL126W 2043 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 ATP6Q0085 780 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 RPS26BYER131W 360 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 SPO13YHR014W 876 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YJL007CYJL007C 315 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 SYM1YLR251W 594 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 GPI15YNL038W 690 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YNL179CYNL179C 438 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 PDR11YIL013C 4236 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 ALY1YKR021W 2748 nt2.65□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 BIT61YJL058C 1632 nt2.64□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YGL015CYGL015C 393 nt2.64□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 PAU23YLR037C 375 nt2.64□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TOM22YNL131W 459 nt2.64□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 HNT1YDL125C 477 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 SEC31YDL195W 3822 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 OTU2YHL013C 924 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 MRP49YKL167C 414 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YLR302CYLR302C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 BI4Q0120 1917 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TRS130YMR218C 3309 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TRZ1YKR079C 2517 nt2.63□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YAP3YHL009C 993 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 HRI1YLR301W 735 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 PBI2YNL015W 228 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YNR021WYNR021W 1215 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 CAT5YOR125C 702 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TPS2YDR074W 2691 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 SAP190YKR028W 3102 nt2.62□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TIF35YDR429C 825 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YGR042WYGR042W 816 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 AIM36YMR157C 768 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 HHT2YNL031C 411 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 DGR1YNL130C-A 147 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YOL150CYOL150C 312 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YPL034WYPL034W 498 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 RRG8YPR116W 834 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 RPB5YBR154C 648 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 KRE33YNL132W 3171 nt2.61□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TOF1YNL273W 3717 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 BNA7YDR428C 786 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YHR130CYHR130C 336 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 DDR48YMR173W 1293 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 OST2YOR103C 393 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 snR191snR191 274 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 VMA9YCL005W-A 222 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 TFB1YDR311W 1929 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 SSF2YDR312W 1362 nt2.6□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 KAP123YER110C 3342 nt2.59□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 HMRA1YCR097W 381 nt2.59□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 ERG28YER044C 447 nt2.59□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YLR171WYLR171W 390 nt2.59□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 YHC1YLR298C 696 nt2.59□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 LSM2YBL026W 288 nt2.59□□□□□ -1.99
LSP1Q12230 CLN3YAL040C 1743 nt2.59□□□□□ -2
LSP1Q12230 BFR1YOR198C 1413 nt2.59□□□□□ -2
LSP1Q12230 RLI1YDR091C 1827 nt2.58□□□□□ -2
LSP1Q12230 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.58□□□□□ -2
LSP1Q12230 BI2Q0110 1272 nt2.58□□□□□ -2
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