Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 PDS5YMR076C 3834 nt4.9□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 KKQ8YKL168C 2175 nt4.89□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 AFT1YGL071W 2073 nt4.89□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 GAT4YIR013C 366 nt4.89□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 RPL20BYOR312C 519 nt4.89□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 snR32snR32 188 nt4.89□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 MDV1YJL112W 2145 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 TPO2YGR138C 1845 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SEC63YOR254C 1992 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YFR035CYFR035C 345 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 RPL21BYPL079W 483 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YCL046WYCL046W 324 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YFL042CYFL042C 2025 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 TCP1YDR212W 1680 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 ROG1YGL144C 2058 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 PRM15YMR278W 1869 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YGL036WYGL036W 2730 nt4.88□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SNF3YDL194W 2655 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SWC3YAL011W 1878 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 REB1YBR049C 2433 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 PYC2YBR218C 3543 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 DBF4YDR052C 2115 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 UTP8YGR128C 2142 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YOR019WYOR019W 2193 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 ROG3YFR022W 2202 nt4.87□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 AHC1YOR023C 1701 nt4.86□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SLY1YDR189W 2001 nt4.86□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YER077CYER077C 2067 nt4.86□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.86□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YNL144CYNL144C 2223 nt4.86□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 MEF2YJL102W 2460 nt4.86□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 VPS70YJR126C 2436 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 NSP1YJL041W 2472 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 MCM4YPR019W 2802 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 HOS4YIL112W 3252 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP2tY(GUA)D 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP11tY(GUA)F1 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP6tY(GUA)F2 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP7tY(GUA)J1 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP4tY(GUA)J2 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP5tY(GUA)M1 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP8tY(GUA)M2 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SUP3tY(GUA)O 75 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 ALY1YKR021W 2748 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 SEA4YBL104C 3117 nt4.85□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 MNL1YHR204W 2391 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 NUP82YJL061W 2142 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 snR79snR79 84 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YFL065CYFL065C 309 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YLR296WYLR296W 327 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 LCL1YPL056C 306 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YPR146CYPR146C 330 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 YPR203WYPR203W 309 nt4.84□□□□□ -1.63
WSC3Q12215 AMD1YML035C 2433 nt4.84□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 GYL1YMR192W 2163 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 TUP1YCR084C 2142 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 TMN3YER113C 2121 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 VTH1YIL173W 4650 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 VTH2YJL222W 4650 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 snR10snR10 245 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 CWC22YGR278W 1734 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 MCM10YIL150C 1716 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.83□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 MCM3YEL032W 2916 nt4.82□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YOR218CYOR218C 420 nt4.82□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 ETP1YHL010C 1758 nt4.82□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 VIP1YLR410W 3441 nt4.82□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 PDI1YCL043C 1569 nt4.82□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 NOC3YLR002C 1992 nt4.82□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 KAR3YPR141C 2190 nt4.81□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 VID30YGL227W 2877 nt4.81□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YRM1YOR172W 2361 nt4.81□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 OM14YBR230C 405 nt4.81□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 VPS53YJL029C 2469 nt4.81□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 HSC82YMR186W 2118 nt4.81□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 HPC2YBR215W 1878 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 NAB3YPL190C 2409 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 snR75snR75 89 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 CWC21YDR482C 408 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 CDC31YOR257W 486 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YPL044CYPL044C 549 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 BCH2YKR027W 2298 nt4.8□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 PLC1YPL268W 2610 nt4.79□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 FRE8YLR047C 2061 nt4.79□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 ALO1YML086C 1581 nt4.79□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 RNR1YER070W 2667 nt4.79□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt4.79□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 KEX2YNL238W 2445 nt4.78□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 CLN3YAL040C 1743 nt4.78□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 GRX8YLR364W 330 nt4.78□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt4.78□□□□□ -1.64
WSC3Q12215 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms