Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBRQ0VD83 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBRQ0VD83 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms