Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms