Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE4CQ08493 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms