Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB2Q08289 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms