Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TGM3Q08188 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TGM3Q08188 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms