Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms