Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXM1Q08050 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXM1Q08050 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms