Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms