Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DEUP1Q05D60 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms