Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms