Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TLE4Q04727 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TLE4Q04727 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms