Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP7AQ04656 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms