Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YJR087W	YJR087W	351 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YAL042C-A	YAL042C-A	378 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	VPH2	YKL119C	648 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	VPS51	YKR020W	495 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	OST2	YOR103C	393 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	SNF12	YNR023W	1701 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	IRC2	YDR112W	309 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	ATP18	YML081C-A	180 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	MPP6	YNR024W	561 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YPL039W	YPL039W	951 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	SSE1	YPL106C	2082 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YGR050C	YGR050C	357 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YNL046W	YNL046W	519 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YOL150C	YOL150C	312 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YOR364W	YOR364W	369 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	INP51	YIL002C	2841 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	VPS74	YDR372C	1038 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	NCB2	YDR397C	441 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	HYP2	YEL034W	474 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	PDP3	YLR455W	915 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	TAP42	YMR028W	1101 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YNL179C	YNL179C	438 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	LOA1	YPR139C	903 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	ARR2	YPR200C	393 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	KRE33	YNL132W	3171 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YDR029W	YDR029W	315 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	GCN4	YEL009C	846 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	MPO1	YGL010W	525 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	EMP24	YGL200C	612 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	COG2	YGR120C	789 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YGR228W	YGR228W	345 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YMR144W	YMR144W	1029 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	NSL1	YPL233W	651 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YBR071W	YBR071W	636 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YBR209W	YBR209W	318 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	GAL80	YML051W	1308 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	UTP22	YGR090W	3714 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	KIP1	YBL063W	3336 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YJL119C	YJL119C	324 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	HOS4	YIL112W	3252 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	PRP6	YBR055C	2700 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	TRS130	YMR218C	3309 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YNL018C	YNL018C	1839 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YEF3	YLR249W	3135 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	APQ13	YJL075C	417 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	RLP24	YLR009W	600 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	RIO2	YNL207W	1278 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YNR021W	YNR021W	1215 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ECM25	YJL201W	1800 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	AFR1	YDR085C	1863 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	CLN3	YAL040C	1743 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	HSC82	YMR186W	2118 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YDL009C	YDL009C	324 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ARF3	YOR094W	552 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ACM1	YPL267W	630 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ALK2	YBL009W	2031 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YCR108C	YCR108C	192 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	SDC1	YDR469W	528 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	PRS3	YHL011C	963 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	BUD19	YJL188C	309 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	CSE4	YKL049C	690 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YOL159C-A	YOL159C-A	273 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YPL034W	YPL034W	498 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YPL068C	YPL068C	882 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YDR210W-A	YDR210W-A	1317 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	snR84	snR84	550 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	DAD4	YDR320C-A	219 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	GPI8	YDR331W	1236 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	TSA2	YDR453C	591 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YGL042C	YGL042C	306 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	TRM7	YBR061C	933 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	MSS18	YPR134W	807 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YNL034W	YNL034W	1839 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ROY1	YMR258C	1662 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	ACB1	YGR037C	264 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	SCEI	Q0160	708 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YIL029C	YIL029C	429 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	HRI1	YLR301W	735 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	HHT2	YNL031C	411 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YPR172W	YPR172W	603 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SYF1	Q04048	LEU3	YLR451W	2661 nt		2.59	□□□□□ -2
SYF1	Q04048	GYP5	YPL249C	2685 nt		2.59	□□□□□ -2
SYF1	Q04048	SVL3	YPL032C	2478 nt		2.59	□□□□□ -2

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