Protein–RNA interactions for Protein: Q03619

TY1B-ER2, Transposon Ty1-ER2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ER2Q03619 SEC59YMR013C 1560 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 YDL050CYDL050C 372 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 COG1YGL223C 1254 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 AI1Q0050 2505 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 YOL114CYOL114C 609 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 TIM21YGR033C 720 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 EMC2YJR088C 879 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 snR11snR11 258 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 YBR096WYBR096W 693 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-ER2Q03619 SDC1YDR469W 528 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 MGE1YOR232W 687 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 MAL33YBR297W 1407 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 CSM2YIL132C 642 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 SMD3YLR147C 306 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YIL058WYIL058W 285 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 GPN3YLR243W 819 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YIP3YNL044W 531 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 NOP15YNL110C 663 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 DPB3YBR278W 606 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 DXO1YDR370C 1329 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 PDS5YMR076C 3834 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YEL075CYEL075C 369 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 VMA5YKL080W 1179 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YDR124WYDR124W 975 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 STE5YDR103W 2754 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 CTF18YMR078C 2226 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 FIP1YJR093C 984 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YLR053CYLR053C 327 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 HSH49YOR319W 642 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 RIT1YMR283C 1542 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 TRM2YKR056W 1920 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YDL186WYDL186W 834 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YGR290WYGR290W 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YUH1YJR099W 711 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 PCL9YDL179W 915 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 YOR314WYOR314W 330 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 GCD2YGR083C 1956 nt0.9□□□□□ -2.26
TY1B-ER2Q03619 HTA1YDR225W 399 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YGL242CYGL242C 546 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 SNX4YJL036W 1272 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 ISA2YPR067W 558 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 MLH3YPL164C 2148 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 PCL6YER059W 1263 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 FSH1YHR049W 732 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 RSM26YJR101W 801 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 MSA2YKR077W 1092 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 UBX4YMR067C 1251 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 STE24YJR117W 1362 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 SUI2YJR007W 915 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 RRT15YLR162W-A 189 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 IFH1YLR223C 3258 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 LDH1YBR204C 1128 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 STB4YMR019W 2850 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 ZRG8YER033C 3231 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YDL062WYDL062W 426 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 GTR2YGR163W 1026 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 RPA12YJR063W 378 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YBL028CYBL028C 321 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 OMA1YKR087C 1038 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 AIM36YMR157C 768 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 HAP4YKL109W 1665 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 NCL1YBL024W 2055 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 BNA7YDR428C 786 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YJL169WYJL169W 369 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 SWI6YLR182W 2412 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 TAH1YCR060W 336 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 COS7YDL248W 1152 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 YAR075WYAR075W 474 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-ER2Q03619 CTK1YKL139W 1587 nt0.84□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 HUL5YGL141W 2733 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 FCF2YLR051C 654 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 RGM1YMR182C 636 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 NUP145YGL092W 3954 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 RPL31AYDL075W 342 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 UBC13YDR092W 462 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 RNP1YLL046C 750 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 RSA3YLR221C 663 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 MED11YMR112C 396 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 YMR144WYMR144W 1029 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 SHE3YBR130C 1278 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 UBP11YKR098C 2154 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 ESC2YDR363W 1371 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 MED8YBR193C 672 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 SEC1YDR164C 2175 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-ER2Q03619 AVT5YBL089W 1380 nt0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms