Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREMQ03060 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREMQ03060 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREMQ03060 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREMQ03060 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREMQ03060 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREMQ03060 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CREMQ03060 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CREMQ03060 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms