Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms