Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALK2Q01415 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALK2Q01415 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms