Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RELBQ01201 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RELBQ01201 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms