Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEX3Q00994 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms