Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms