Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLTCQ00610 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLTCQ00610 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms